La Bateria Santiago era parte de nuevo sistema de defensa construido en el siglo 18. El ataque de Edward Veron en 1793 despertó la alarma que alteró el sistema de defensa del Caribe. Algunos años después. Se encargó a los ingenieros Ignacio Sala y Manuel Hernández la adecuación del sistema defensivo.

En Portobelo, el fuerte San Fernando, el de San Jerónimo y éste de Santiago pertenecen a esta segunda época defensiva. Las construcciones pierden sus características medievales y adoptan un estilo neoclásico con un aspecto más estilizado. La Bateria Santiago fue proyectada en año 1753.